El programa de Áreas Importantes para Aves y Biodiversidad (IBA, por sus siglas en inglés) de Birdlife International tiene como objetivo la identificación, monitoreo y protección de sitios claves para la conservación de la avifauna mundial. Audubon Panamá utiliza esta herramienta para priorizar y orientar sus acciones de conservación, que generalmente se realizan junto a organizaciones locales de base comunitaria, con apoyo de aliados estratégicos.

De las 53 IBA existentes en el país, Audubon Panamá ha centrado sus esfuerzos de conservación en las IBA Parte Alta de la Bahía de Panamá y Humedales de Chimán y El Chorogo-Palo Blanco. Adicionalmente, se han identificado nueve áreas de trabajo en las cuales esperamos contar con apoyo para poder realizar acciones coordinadas de conservación: Parque Natural Metropolitano, Ribera Oeste del Canal, Bahía de Parita, Humedales de Santa María, Bosques del Golfo de los Mosquitos, Cerro Santiago, Manglares de David, Parque Nacional Volcán Barú y Parque Internacional La Amistad.